한국예술종합학교는 1993년부터 매년 1개원씩 개원하며 1998년 3월에 6개원 체제를 완비했다. 원 단위로 활동하던 학생회 조직은 전통예술원을 제외한 5개원이 개원한 시점인 1997년에 총학생회장을 선발함으로써 제1대 총학생회를 출범했다. 이때의 방식은 각 원학생회를 구성한 다음, 그중에서 총학생회장을 선발하는 것이었다. 이 방식은 전통예술원이 개원하면서 6개원 학생회가 모두 갖춰진 이후인 2000년까지 유지되었다. 2001년부터 학생회 선거를 통해 총학생회장을 선발하였으며, 이 해에는 최초의 학생 총대의원회가 개최되기도 했다.

총학생회는 참다운 예술문화 창조를 바탕으로 자주적인 학생 자치 활동을 통하여 학생 간의 유대를 돈독히 하고 예술학도로서의 자질을 함양하며 학생의 권익 보호를 위하여 활동하고 있다. 총학생회의 주요활동 영역은 1)학생복지, 2)예술창조·학술·체육문화 사업, 3)교양·취미·연대, 4)그 밖의 학생 자치 활동에 필요한 사업 등이다.