1993년에 한국예술종합학교는 서초동캠퍼스 신축 부지로 예술의전당 오페라하우스 옆 야외음악당 부지를 제안하였으나, 서울시는 녹지 훼손의 우려가 있다는 까닭으로 주차장 부지를 대안으로 제시했다. 하지만 주차장 부지는 구조상 학교 건물을 신축하기에 어려웠다. 1996년 4월 8일에 서초구는 한국예술종합학교 서초동캠퍼스 신축 부지가 예술의전당 서예관과 국립국악당 사이의 부지로 결정되었다는 내용을 발표했다. 서초동캠퍼스는 개교 후 처음으로 자체 학교 건물로 마련된 공간으로, 1996년 12월 18일 기공식 이후 1999년 9월 29일에 준공식을 가졌다. 예술의전당 서예관과 국립국악당 사이에 신축된 건물은 대지 4,940평에 지하 2층, 지상 4층(연건평 4,980평) 규모로, 그간 예술의전당과 국립극장 별관을 각각 임대하여 사용해 오던 음악원과 무용원이 들어섰다.